Facultad de Ingeniería y Ciencias Departamento de Ciencias Químicas y Recursos Naturales Carrera de Bioquímica

CLEDIR RODRIGUES SANTOS AFILIACIÓN Departamento de Ciencias Químicas y Recursos Naturales, Facultad de Ingeniería y Ciencias, Universidad de La Frontera.

CONTACTO Av. Francisco Salazar 01145, Casilla 54-D, Código Postal 4811230, Temuco, Chile Teléfono: +56 (45) 2596726 E-mail: [email protected]

GRADOS ACADÉMICOS Y ESTUDIOS PROFESIONALES 2007 2002

Doctor en Química, University of Porto, Porto, Portugal. Licenciado en Química, Federal Rural University of Pernambuco, Recife, Brazil.

LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN Nuevos biomarcadores para la quimiotaxonomía fúngica Hongos y cambio climático Nuevas técnicas para la preservación fúngica a largo plazo

PUBLICACIONES (últimos 5 años) 1. Moreira, I.M.V., L.F. Vilela, M.G.C.P. Miguel, N. Lima, C. Santos & R.F. Schwan. 2017. Impact of microbial cocktail used as starter culture on cocoa fermentation and chocolate flavor. Molecules 22: 1-20. 2. Miguel, M.G.D.P., L.V.D. Reis, P. Efraim, C. Santos, N. Lima & R.F. Schwan. 2017. Cocoa fermentation: Microbial identification by MALDI-TOF MS, and sensory evaluation of produced chocolate. LWT-Food Science and Technology 77: 362-369. 3. Santos, C., J.A. Ventura & N. Lima. 2016. New insights for diagnosis of pineapple fusariosis by MALDI-TOF MS technique. Current Microbiology 73(2): 206-213.

Carrera de Bioquímica

Facultad de Ingeniería y Ciencias Departamento de Ciencias Químicas y Recursos Naturales Carrera de Bioquímica

4. Oliveira, H.M.B., C. Santos, R.R.M. Paterson, N.B. Gusmão & N. Lima. 2016. Fungi from a groundwater-fed drinking water supply system in Brazil. International Journal of Environmental Research and Public Health 13(304): 1-11. 5. Elgueta, E., C. Santos, N. Lima & M.C. Diez. 2016. Atrazine dissipation in a biobed system inoculated with immobilized white-rot-fungi. Archives of Agronomy and Soil Science 62(10): 1451-1461. 6. Elgueta, E., C. Santos, N. Lima & M.C. Diez. 2016. Immobilization of the white-rot fungus Anthracophyllum discolor to degrade the herbicide atrazine. Archives of Agronomy and Soil Science 6(104). 7. Chang, S., M.P. Carneiro-Leão, B.F. Oliveira, C. Souza-Motta, N. Lima, C. Santos & N.T. Oliveira. 2016. Polyphasic Approach Including MALDI-TOF MS/MS Analysis for Identification and Characterisation of Fusarium verticillioides in Brazilian Corn Kernels. Toxins 8(3). 8. Ottoni, C., M.F. Simoes, S. Fernandes, C. Santos & N. Lima. 2016. High Laccase Expression by Trametes versicolor in a Simulated Textile Effluent with Different Carbon Sources and PHs. International Journal of Environmental Research and Public Health 13(8): 778. 9. Sampaio, J., D. Machado, A.M. Gomes, I. Machado, C. Santos, N. Lima, M.J. Carvalho, A. Cabrita, A. Rodrigues & M. Martins. 2016. Deciphering the Contribution of Biofilm to the Pathogenesis of Peritoneal Dialysis Infections: Characterization and Microbial Behaviour on Dialysis Fluids. PLOS ONE 11(6): e0157870. 10. Santos, C., J.A. Ventura, H. Costa, P.M.B. Fernandes & N. Lima. 2016. MALDI-TOF MS to identify the pineapple pathogen Fusarium guttiforme and its antagonist Trichoderma asperellum on decayed pineapple. Tropical Plant Pathology 40: 227-232. 11. Souza, P., T. Grigoletto, L.A. Moraes, L. Abreu, L.H. Guimaraes, C. Santos, L. Galvao & P. Cardoso. 2016. Production and chemical characterization of pigments in filamentous fungi. Microbiology-SGM 162: 12-22. 12. Oliveira, M.M.E., C. Santos, P. Sampaio, O. Romeo, R. Almeida-Paes, C. Pais, N. Lima & R.M. ZancopéOliveira. 2015. Development and optimization of a new MALDI-TOF protocol for the identification of Sporothrix species complex. Research in Microbiology 166: 102-100. 13. Silva, F.C., S.M. Chalfoun, L.R. Batista, C. Santos & N. Lima. 2015. Use of polyphasic approach including MALDI-TOF MS for identification of Aspergillus section Flavi strains isolated from food commodities in Brazil. Annals of Microbiology 65(4): 2119-2129. 14. Lima-Neto, R., C. Santos, N. Lima, P. Sampaio, C. Pais & R.P. Neves. 2015. Application of MALDI-TOF MS for requalification of a Candida clinical isolates culture collection. Brazilian Journal of Microbiology 45(2): 515522. 15. Nicolau, A., L. Sequeira, C. Santos & M. Mota. 2014. Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-offlight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) applied to diatom identification: influence of culturing age. Aquatic Biology 20(2): 139-144. Carrera de Bioquímica

Facultad de Ingeniería y Ciencias Departamento de Ciencias Químicas y Recursos Naturales Carrera de Bioquímica

16. Maciel, M.D.H.C., C.A. Ottoni, P.N. Herculano, T.S. Porto, A.L.F. Porto, C. Santos, N. Lima, K.A. Moreira & C. Souza-Motta. 2014. Purification of polygalacturonases produced by Aspergillus niger using an aqueous twophase system. Fluid Phase Equilibria 371: 125-130. 17. Rodrigues, A., M. Maciel, C. Santos, D. Machado, J. Sampaio, N. Lima, M.J. Carvalho, A. Cabrita & M. Martins. 2016. Peritoneal dialysis infections: an opportunity for improvement. American Journal of Infection Control 42(9): 1016-1018. 18. Pereira, L., N. Dias, J. Carvalho, S. Fernandes, C. Santos & N. Lima. 2014. Synthesis, characterization and antifungal activity of chemically and fungal-produced silver nanoparticles against Trichophyton rubrum. Journal of Applied Microbiology 117(6): 1601-1613. 19. Ottoni, C.A., L. Lima, C. Santos & N. Lima. 2014. Effect of Different Carbon Sources on Decolourisation of an Industrial Textile Dye Under Alkaline-Saline Conditions. Current Microbiology 68(1): 53-58. 20. Pereira, L., N. Dias, C. Santos & N. Lima. 2015. The use of MALDI-TOF ICMS as an alternative tool for Trichophyton rubrum identification and typing. Enfermedades Infecciosas y Microbiologia Clinica 32(1): 1117. 21. Cruz, R., C. Santos, J.S. Lima, K.A. Moreira & C. Souza-Motta. 2013. Diversity of Penicillium in soil of Caatinga and Atlantic Forest areas of Pernambuco, Brazil: an ecological approach. Nova Hedwigia 97(3-4): 543-556. 22. Maciel, M., C. Ottoni, C. Santos, N. Lima, K. Moreira & C. Souza-Motta. 2013. Production of polygalacturonases by Aspergillus section Nigri strains in a fixed bed reactor. Molecules 18(2): 1660-1671. 23. Passarini, M.R.Z., C. Santos, N. Lima, R.G.S. Berlinck, & L.D. Sette. 2013. Filamentous fungi from the Atlantic marine sponge Dragmacidon reticulatum. Archives of Microbiology 195(2): 99-111. 24. Simões, M.F., C. Santos & N. Lima. 2013. Structural diversity of Aspergillus (section Nigri) spores. Microscopy and Microanalysis 19(5): 1151-1158. 25. Simões, M.F., C. Santos & N. Lima. 2013. The importance of structural diversity of spores in the taxonomy of Aspergillus (section Nigri). Microscopy and Microanalysis 19: 77-78. 26. Siqueira, V.M., H.M.B. Oliveira, C. Santos, R.R.M. Paterson, N.B. Gusmão & N. Lima. 2013. Biofilms from a Brazilian water distribution system include filamentous fungi. Canadian Journal of Microbiology 59(3): 183188. 27. Ottoni, C.A., C. Santos, Z. Kozakiewicz & N. Lima. 2013. White-rot fungi capable of decolourising textile dyes under alkaline conditions. Folia Microbiologica 58(3): 187-193.

Carrera de Bioquímica

Facultad de Ingeniería y Ciencias Departamento de Ciencias Químicas y Recursos Naturales Carrera de Bioquímica

PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN (últimos 5 años) 1. 2015-2017. Aproveitamento de subprodutos da indústria madeireira e da agroindústria da Amazônia para o cultivo de cogumelos: produto de importância econômica e nutracêutica. Co-investigador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas, Brasil. 2. 2016-2017. Fungal resources and biotechnology: Could methods of preservation affect the biotechnological potential of fungal strains preserved over the time in Culture Collections? Investigador responsable, PIADIUFRO, Dirección de Investigación Universidad de La Frontera. 3. 2016-2018. Effect of freezing-drying on phenotypic and genotypic stability of filamentous fungi with biotechnological interest: A proteomics and molecular biology approach. Investigador responsable, Dirección de Investigación Universidad de La Frontera DI16-0135. 4. 2015-2017. Micoteca URM: caracterização e disponibilização do acervo como fonte de recursos microbiológicos. Co-investigador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estadodo de Pernam, Brasil. 5. 2013-2015. HiCC - Luta biológica por hipovirulência contra o cancro do castanheiro em Portugal. Coinvestigador, Fundação para a Ciência e Tecnologia, Portugal. 6. 2012-2015. Microbial Resource Research Infrastructure (MIRRI). Co-investigador, European Commission. 7. 2012-2015. Caracterização do acervo da Micoteca URM visando a disponibilização de culturas como fonte de recursos biotecnológicos. Co-investigador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Pernambuco, Brasil. 8. 2012-2015. Taxonomia polifásica e aplicação de fungos: caracterização de linhagens de Penicillium. Coinvestigador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Pernambuco, Brasil. 9. 2012-2015. Caracterização taxonômica de fungos endofíticos de plantas da Caatinga e de culturas preservadas na Micoteca URM. Co-investigador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Pernambuco, Brasil. 10. 2011-2013. Caracterização taxonômica, micotoxigênica e enzimática de culturas de Aspergillus seção Nigri da Micoteca URM para clarificação de suco. Co-investigador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Pernambuco, Brasil. 11. 2010-2014. Aproveitamento de Rejeitos Industriais na Produção de Biossurfactante e de Lipídeos por Candida glabrata. Co-investigador, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Brasil. 12. 2010-2013. Ampliação e caracterização do acervo da Micoteca UR M visando a disponibilização de culturas como fonte de recursos biotecnológicos para o estado de Pernambuco. Co-investigador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Pernambuco, Brasil.

Carrera de Bioquímica

Facultad de Ingeniería y Ciencias Departamento de Ciencias Químicas y Recursos Naturales Carrera de Bioquímica

13. 2010-2013. Utilização de poligalacturonases produzidas por Aspergillus niger para clarificação do suco de umbu-cajá e avaliação taxonômica e micotoxigênica por MALDI-TOF MS. Co-investigador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Pernambuco, Brasil. 14. 2009-2012. European Consortium of Microbial Resources Centres Project (EMbaRC). Co-investigador, European Commissión 7th Framework Programme. 15. 2008-2015. Coleções de culturas de microrganismos Micoteca URM e UFPEDA da Universidade Federal de Pernambuco. Co-investigador, Financiadora de Estudos e Projetos – FINEP, Brasil. 16. 2007-2018. Preparação de Nanossistemas Furtivos e Dirigíveis para o Tratamento da Tuberculose. Coordinador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Pernambuco, Brasil.

DIRECCIÓN Y CO-DIRECCIÓN DE TESIS DE PRE Y POSTGRADO Dirección de Tesis de Postgrado: 2017

Jéssica Souza da Costa. Aspergillus section Nigri in Chilean traditional chilli (Merkén). PhD Student in of Science of Natural Resources, Universidad de La Frontera, Temuco, Chile, in Double PhD Degree with the Dottorato per il Sistema Agroalimentare, Università Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza, Italy. Thesis in Progress.

2017

Blenda Naara Santos Silva. Bioprospecção de fungos endofíticos do guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis). PhD Student in Tropical Agronomy, Federal University of Amazonas, Manaus, Brazil in Double PhD Degree with the Doctoral Programme of Science of Natural Resources, Universidad de La Frontera, Temuco, Chile. Thesis in Progress.

2016

Rodrigo Nicolas Rodriguez Quiroz. Aspergillus section Nigri and Ochratoxin A contamination of Chilean traditional chilli (Merkén). MSc Student in Bioengineering, University of Minho, Braga, Portugal, with Double MSc Degree with the Doctoral and Master Programme in Science of Natural Resources, Universidad de La Frontera, Temuco, Chile. Thesis in Progress.

2016

Marcely Cristiny Andrade da Silva. Atividade enzimática de Colletotrichum guaranicola Albuq. PhD in Tropical Agronomy, Federal University of Amazonas, Manaus, Brasil. Tesis Finalizada.

2015

Nazareth Magnago Klein. Estudo genômico e fenotípico, que inclui a abordagem de perfis proteômicos por MALDI-TOF MS, de isolados de hemoculturas para o abastecimento de uma coleção de bactérias de referência. PhD in Chemical and Biological Engineering, University of Minho, Braga, Portugal. Tesis Finalizada..

2014

Susane Cavalcanti Chang. Abordagem polifásica para identificação de Fusarium verticillioides micotoxigênicos isolados de culturas de milho em Pernambuco. PhD in Fungal Biology, Federal University of Pernambuco, Recife, Brasil. Tesis Finalizada.

Carrera de Bioquímica

Facultad de Ingeniería y Ciencias Departamento de Ciencias Químicas y Recursos Naturales Carrera de Bioquímica

2013

Lidiane Roberta Cruz da Silva. Espécies de Penicillium em solos de Caatinga e Mata Atlântica, produção de tanase e detecção do potencial micotoxigênico. PhD in Fungal Biology, Federal University of Pernambuco, Recife, Brasil. Tesis Finalizada.

2013

Marta Filipa de Jesus Simões. Quality parameters in a culture collection - Micoteca da Universidade do Minho. PhD in Chemical and Biological Engineering, University of Minho, Braga, Portugal. Tesis Finalizada.

2013

Fabiana Aparecida Couto. Identificação de espécies do gênero Aspergillus, Seções Nigri, Flavi e Circumdati por taxonomia polifásica. PhD in Agricultural Microbiology, Federal University of Lavras, Lavras, Brazil.

2012

Cristiane Angélica Ottoni. Estudos de degradabilidade de corantes azo de aplicação têxtil por fungos lenhinolíticos. PhD in Chemical and Biological Engineering, University of Minho, Braga, Portugal. Tesis Finalizada.

2016

Jorge Pamplona Pagnossa. Adaptação e adaptação cruzada de Biofilmes de Salmonella sp. a cinamaldeído, citral e linalol. 2016. Master in Agricultural Microbiology, Federal University of Lavras, Lavras, Brasil. Tesis Finalizada.

2015

Lucas Vieira de Faria. Indentificação por MALDI-TOF MS de isolados de Aspergillus Seção Nigri e avaliação do potencial biotecnológico na produção de biossurfactantes. 2015. Master in Agricultural Microbiology, Federal University of Lavras, Lavras, Brasil. Tesis Finalizada.

2011

Lídia Sofia Siqueira. Physiological characterisation of Diatom Cultures Using MALDI-TOF MS. 2011. Master in Biomedical Engineering, University of Minho, Braga, Portugal.

2011

Maria da Graça Cerqueira Pinto. Implementação de um método expedito para a classificação de bacteriófagos usando MALDI-TOF MS. 2011. Master in Biomedical Engineering, University of Minho, Braga, Portugal. Tesis Finalizada.

Dirección de Tesis de Pregrado: 2016

Rodrigo Rodriguez. Molecular analysis of populations of filamentous fungi on grapes for wine production: genetic markers for the detection of potencial ochratoxigenic fungi. Bioquímica, Facultad de Ingeniería y Ciencias, Universidad de La Frontera. Tesis Finalizada.

Carrera de Bioquímica