Allgemeine Bemerkungen

1 Allgemeine Bemerkungen •  Empfohlene Literatur: Voet et al.: „Lehrbuch der Biochemie“ „Fundamentals of Biochemistry“ •  Termine 2011 (immer Mittwoc...
Author: Imke Schmitz
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Allgemeine Bemerkungen •  Empfohlene Literatur: Voet et al.: „Lehrbuch der Biochemie“ „Fundamentals of Biochemistry“ •  Termine 2011 (immer Mittwochs 1015 – 1200 Uhr): (insgesamt 14)

02.

09.

01.

16.

23.

30.

März

06.

13.

April

11.

18.

25.

Mai

08.

15.

22.

Juni

•  Skript verfügbar (ÖH) oder Download •  Schriftliche Prüfung am Ende des Semesters nach Absprache 2

Inhaltsverzeichnis - Kapitel 1. Einleitung: Die Chemie des Lebens 2. Kohlenhydrate 3. Lipide und Membranen 4.  Nukleinsäuren 5. Aminosäuren und Proteine 6. Enzyme und Katalyse 7. Vitamine & Kofaktoren 8.  Stoffwechsel I: Kohlenhydratstoffwechsel 9. Stoffwechsel II: Citratcyclus & oxidative Phosphorylierung 10. Stoffwechsel III: β-Oxidation & Aminosäureabbau 11. Stoffwechselphysiologie & Ernährungsbiochemie 3

Inhaltsverzeichnis - Kapitel 1. Einleitung: Die Chemie des Lebens 2. Kohlenhydrate 3. Lipide und Membranen 4.  Nukleinsäuren 5. Aminosäuren und Proteine 6. Enzyme und Katalyse 7. Vitamine & Kofaktoren 8.  Stoffwechsel I: Kohlenhydratstoffwechsel 9. Stoffwechsel II: Citratcyclus & oxidative Phosphorylierung 10. Stoffwechsel III: β-Oxidation & Aminosäureabbau 11. Stoffwechselphysiologie & Ernährungsbiochemie 4

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Biochemie - die Chemie des Lebens Einleitung

Kennzeichen biologischer Systeme: Erzeugung von Nachkommen mit gleiche Artcharakteristika ( Replikation) Anpassung ( Mutabilität) Stoffwechsel: Selektion und Beschleunigung chemischer Reaktionen ( Katalyse)

 Die Biochemie untersucht diese Prozesse auf molekularer Ebene

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Biologie & Biochemie: Historische Wissenschaften Einleitung

~3,5 billion yrs

Anm.: Billion = Milliarde! 7

8

Einleitung

Evolutionstheorie: Grundlage für die Entwicklung natürlicher Arten

Charles Darwin (1809-1882)

Alfred Russel Wallace (1823-1913)

„On the origin of species by means of natural selection“ (1859)

„On the tendency of varieties to depart indefinitely from the original type“* (1858) *manuscript sent to C. Darwin

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Ein- und Mehrzellige Organismen Einleitung

Alle Lebewesen basieren auf einer morphologischen Einheit, die als Zelle bezeichnet wird.

Es gibt zwei verschiedene Zelltypen: Prokaryonten und Eukaryonten: Eukaryonten (Gr.: eu, gut/richtig + karyon, Kern) besitzen einen Zellkern (Nukleus), der von einer Membran umschlossen ist. Dieser enthält die DNA, das genetische Material. Eukaryonten können multizelluläre Organismen bilden. Prokaryonten (Gr.: pro, bevor) besitzen keinen Zellkern und bilden einzellige Organismen (Bakterien). 10

Ein- und Mehrzellige Organismen Einleitung

Prokaryont : (Bakterium)

Eukaryont : (Hefe)

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Prokaryonten (Bakterien) Einleitung

•  Zuerst beschrieben von Antoni van Leeuwenhoek (1683) •  Einfacher Aufbau (1-10 µm) •  Verschiedene Formen: - Sphärisch (Kokken) - Stäbchenförmig (Bazillen) - Helikal (Spirillen) •  Umgeben von einer Plasmamembran (70 Å) und einer Zellwand (30 bis 250 Å)

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Aufbau einer eukaryontischen Zelle Einleitung

13

Bausteine eines Bakteriums Einleitung

Hauptelemente organischen Lebens: C, H, O, N, S, P Allerdings auch andere Elemente denkbar: z.B. As  GFAJ-1 (Familie der Halomonadaceae)

14

Vorkommen der chemischen Elemente Einleitung

4

5

12

9





B

Be

F 14



Si

Mg 23

V

24

Cr

25

Mn

26

27

28

29

Fe

Co

Ni

Cu

42

30 Zn

Se

50

51

Sn

Sb

48 Cd

72

80

81

82

Hg

Tl

Pb

34

As

Mo

W

33





35

Br 53

I

15

Minamata-Krankheit Einleitung

•  Einleitung von Methylquecksilberjodid ins Meer (50er Jahre) •  vermutlich bis zu 17.000 Erkrankungen, ca. 3000 Todesfälle •  Schädigung des zentralen Nervensystems

Photos by William Eugene Smith

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Arsen: Vom Gift zum ersten Antibiotikum Einleitung

•  Arsentrioxid war im Mittelalter ein beliebtes Gift! •  Um 1910 entwickelt Paul Ehrlich das erste Antibiotikum auf Basis einer organischen Arsenverbindung („Salvarsan“, lat.: „Sei gegrüsst, Arsen!“)

Paul Ehrlich (1854-1915)

•  Salvarsan war das erste wirksame Mittel gegen Syphilis und führte zu einer dramatischen Reduktion der Mortalität (vertrieben durch die „IG Farben“)

17

Der Baum des Lebens Einleitung

Eukaryonten (besitzen einen Zellkern): Pflanzen Pilze Tiere Protisten

Prokaryonten (kein Zellkern): Eubakterien („Echte Bakterien“)

Archaebacteria

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Endosymbiontenhypothese Einleitung

http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/organelles.html

19

Von Proteinsequenzen zur Evolution Einleitung

Evolution kann über Sequenzvergleiche von konservierten Proteinen zurückverfolgt werden (Hämoglobin)

20

Verfügbare Energiequellen Einleitung

Autotroph Griechisch: autos, selbst + trophikos, ernähren

Können alle zellulären Bestandteile aus Wasser, Kohlendioxid, Ammoniak und Sulfiden herstellen

Heterotroph Griechisch: hetero, anders + trophikos, ernähren Gewinnen Energie durch die Oxidation von organischem Material (überwiegend produziert von autotrophen Organismen!) 21

Autotrophe Organismen Einleitung

Photoautotroph

Chemolithotroph

Nutzen die Lichtenergie der Sonne für die Gewinnung organischer Verbindungen (Kohlenhydrate):  Photosynthese durch Blaualgen & Pflanzen: dabei wird Wasser als Elektronenlieferant für die Reduktion von CO2 herangezogen.

Griechisch: lithos, Stein

Dieser Prozess wird für gesamten atmosphärischen verantwortlich gemacht!

Wasserstoff+Schwefelsäure zu Schwefelwasserstoff+Wasser

den O2

Produzieren Energie durch die Oxidation von anorganischen Stoffen wie Ammoniak, Sulfid oder Eisen z.B. sulfatreduzierende Bakterien:

4 H2 + H2SO4 → H2S + 4 H2O

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Stoffwechselprozesse Einleitung

Katabolismus

Anabolismus

Abbau von Nährstoffen und Zellbestandteilen zur Produktion von nutzbarer Energie (ATP) und Verwendung der Abbauprodukte für den Aufbau artspezifischer Materialien

Aufbau von benötigten Biomolekülen, wobei die Energie und die Ausgangsmaterialien von katabolen Prozessen bereitgestellt werden

Katabole und anabole Prozesse sind daher miteinander vernetzt und sind einer gemeinsamen Regulation unterworfen! 23

Stoffwechselprozesse Einleitung

Biologische Systeme sind offene Systeme, d.h. sie stehen im Stoff- und Energieaustausch mit ihrer biotischen und abiotischen Umgebung. Biochemische Prozesse greifen in lokale und globale Stoffkreisläufe ein: Photosynthese, Stickstofffixierung, CO2Fixierung, Methanogenese, Denitrifikation, Nitrifikation, etc.)

24

Funktion von Biomolekülen Einleitung

•  ENERGIElieferanten •  Aufbau von STRUKTUREN •  INFORMATIONsspeicher (DNA) •  KATALYSATOREN (Proteine/Enzyme) •  SIGNALübertragung

25

Molekulare Bausteine Einleitung

Es gibt vier Grundbausteine: 1.  2.  3.  4. 

Proteine (Griechisch: proteios, „von besonderer Bedeutung“) Nukleinsäuren Polysaccharide (Griechisch: sakcharon, Zucker) Lipide (Griechisch: lipos, Fett)

Die ersten 3 Gruppen treten als polymere Verbindungen auf:

Aminosäuren Nukleotide

Monosaccharide 26

Biomoleküle bilden hierarchische Ebenen Einleitung

In der Biochemie wird der Versuch unternommen die Eigenschaften der komplexeren Ebenen durch die chemisch-physikalischen Eigenschaften der Bausteine der jeweils niedrigeren Ebene zu erklären:

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Biochemie bildet die molekulare Grundlage Einleitung

Biochemie verbindet die molekulare Ebene mit der makroskopischen Ebene, und leistet wichtige Beiträge zum Verständnis physiologischer Prozesse.

Darüber hinaus kann die Biochemie Erkrankungsprozesse auf einer molekularen Ebene erklären.

28

Informationsmoleküle: Das genetische Material Einleitung

Desoxyribonukleinsäure genetische Information.

(DNA)

trägt

die

Das lineare Polymer ist aus 4 verschiedenen Nukleotiden aufgebaut, deren Sequenz den Inhalt der genetischen Information spezifiziert („Handlungsanweisung“ für die Biosynthese der artspezifischen Proteine).

“Within the DNA is written not only our histories as individuals but the whole history of the human race” Brian Sykes in “The seven daughters of Eve” 29

Genome besitzen eine artspezifische Grösse Einleitung

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Biochemie als zentrale Biowissenschaft Einleitung

Molekulare Medizin und Krankheiten Die Biochemie erklärt die chemischen Prozesse und ihre Regulation und liefert damit einen Schlüssel zum Verständnis von pathologischen Prozessen.

Zell- und Entwicklungsbiologie Die Biochemie erklärt Unterschied zwischen Arten auf einer molekularen Ebene und vermittelt Einblicke in entwicklungsbiologische Programme.

Biochemie

Evolutionsbiologie Die Weitergabe von genetischer Information bestimmt den Weg der Evolution. Die Biochemie erklärt die Bedeutung von Mutationen und ihres Einflusses auf metabolische Prozesse.

Ökologie Viele biochemische Prozesse in biologischen Systemen beeinflussen die Biosphäre der Erde.

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